NextGeneration Sequencing Data Analysis

NextGeneration Sequencing Data Analysis

Next-generation DNA and RNA sequencing has revolutionized biology and medicine. With sequencing costs continuously dropping and our ability to generate large datasets rising, data analysis becomes more important than ever. Next-Generation Sequencing Data Analysis walks readers through next-generation sequencing (NGS) data ana......
fra 1 399,13
Tilgjengelig i 1 butikker
Forhåndsbestill
Frakt og levering
Beskrivelse
Next-generation DNA and RNA sequencing has revolutionized biology and medicine. With sequencing costs continuously dropping and our ability to generate large datasets rising, data analysis becomes more important than ever. Next-Generation Sequencing Data Analysis walks readers through next-generation sequencing (NGS) data analysis step by step for a wide range of NGS applications. For each NGS application, this book covers topics from experimental design, sample processing, sequencing strategy formulation, to sequencing read quality control, data preprocessing, read mapping or assembly, and more advanced stages that are specific to each application. Major applications include:RNA-seq: Both bulk and single cell (separate chapters)Genotyping and variant discovery through whole genome/exome sequencingClinical sequencing and detection of actionable variants De novo genome assembly ChIP-seq to map protein-DNA interactionsEpigenomics through DNA methylation sequencing Metagenome sequencing for microbiome analysis Before detailing the analytic steps for each of these applications, the book presents introductory cellular and molecular biology as a refresher mostly for data scientists, the ins and outs of widely used NGS platforms, and an overview of computing needs for NGS data management and analysis. The book concludes with a chapter on the changing landscape of NGS technologies and data analytics. The second edition of this book builds on the well-received first edition by providing updates to each chapter. Two brand new chapters have been added to meet rising data analysis demands on single-cell RNA-seq and clinical sequencing. The increasing use of long-read sequencing has also been reflected in all NGS applications. This book discusses concepts and principles that underlie each analytic step, along with software tools for implementation. It highlights key features of the tools while omitting tedious details to provide an easy-to-follow guide for practitioners in life sciences, bioinformatics, biostatistics, and data science. Tools introduced in this book are open source and freely available.

Produktinformasjon

NextGeneration Sequencing Data Analysis - En revolusjon innen dataanalyse

Next-generation DNA og RNA sekvensering har satt en ny standard innen biologi og medisin. I en tid der kostnadene for sekvensering stadig synker og muligheten til å generere store datasett øker, blir dataanalyse essensielt. Boken NextGeneration Sequencing Data Analysis guider deg gjennom trinn for trinn av NGS dataanalyse, delt opp i en rekke anvendelser som benytter seg av NGS-teknologi.

Hva du kan forvente fra denne boken

Boken dekker en rekke viktige emner, inkludert:

  • Eksperimentell design: Hvordan lage en plan for sekvensering.
  • Prøvebehandling: Effektive teknikker for forberedelse av prøver.
  • Strategi for sekvensering: Skreddersy sekvenseringsmetoder for dine behov.
  • Kvalitetskontroll av sekvenseringsdata: Sikre dataenes pålitelighet.
  • Dataforbehandling: Rensing og klargjøring av dataene dine.
  • Lesemapping og samling: Effektive metoder for dataorganisering.

Krevd kunnskap for NGS-analyse

For å hjelpe deg i gang inkluderer boken en introduksjon til cellulær og molekylær biologi, informasjon om populære NGS-plattformer og en oversikt over de nødvendige databehandlingsverktøyene. Med fokus på applikasjoner som:

  • RNA-seq: Omfatter både bulk og enkeltcelleanalyser.
  • Genotyping og variantoppdagelse: Gjennom hele genomet og eksofanger.
  • Klinisk sekvensering: For å identifisere handlingsbare varianter.
  • De novo-genom samling: Bygg opp genomer fra bunnen av.
  • ChIP-seq: Kartlegging av protein-DNA-interaksjoner.
  • Epigenomikk: Gjennom DNA metylasjons sekvensering.
  • Metagenom sekvensering: Analyser av mikrobiomer.

Oppdateringer i den andre utgaven

Denne andre utgaven av NextGeneration Sequencing Data Analysis bygger videre på den første ved å tilby oppdateringer gjennom alle kapitlene. To helt nye kapitler omhandler den økende etterspørselen etter dataanalyse innen enkeltcelle RNA-seq og klinisk sekvensering. I tillegg er det nå reflektert i alle NGS-applikasjoner på den økende bruken av long-read sekvensering.

Systematisk og lettfattelig, gir boken innsikt i både prinsipper og konsepter som understøtter hver analytisk fase, sammen med anbefalte programvareverktøy for implementering. Alt dette kombinert gjør NextGeneration Sequencing Data Analysis til et uunnværlig redskap for fagfolk innen livsvitenskap, bioinformatikk, biostatistikk og datavitenskap.

Spesifikasjon

Produkt
ProduktnavnNextGeneration Sequencing Data Analysis
MerkeOther Brand

Pris og prishistorikk

Akkurat nå er 1 399,13 den billigste prisen for NextGeneration Sequencing Data Analysis blant 1 butikker hos Prisradar. Sjekk også vår topp 5-rangering av beste matematikk og naturfag for å være sikker på at du gjør det beste kjøpet.

Prisutvikling:
Vokser
Laveste pris:
1 159,2
Gjennomsnittspris:
1 314,-
Høyeste pris:
1 399,13
Beste tilbudet:
platekompaniet.no
Ikke tilgjengelig